اوصت دراسة مصرية حديثة بمعالجة مياه الصرف الزراعي والصناعي والصحي التي تصب في بحيرة المنزلة, خصوصا مصرف بحر البقر, وتتبع التغيرات البيولوجية والكيميائية أمام مصبات هذه المصارف, وداخل البحيرة.
كي يتم الحفاظ عليها باعتبارها من أهم مصادر الثروة السمكية بمصر.
كما أوصت الدراسة بتطبيق القانون رقم4 لسنة1994 الذي يحظر التخلص من النفايات الصناعية والمنزلية والزراعية والصلبة في المسطحات المائية; بالإضافة الي رصد وتتبع التغيرات الحادثة بالبحيرة للوصول إلي وسائل تحد من التدهور الحادث بها, من خلال تحليل الصور الفضائية والزيارات الحقلية والتحاليل المعملية وتطبيق برامج نظم المعلومات الجغرافية.
الدراسة عنوانها استخدام تقنيات الاستشعار من البعد ونظم المعلومات الجغرافية لتعظيم العائد الاقتصادي لبحيرة المنزلة, وتمت بالتعاون بين كل من: كلية العلوم بجامعة عين شمس والهيئة القومية للاستشعار عن بعد, عبر الإشراف علي الدراسة التي أجرتها الباحثة هاجر محمود, بهدف وضع خطة لإدارة بيئة بحيرة المنزلة, وذلك تحت إشراف الدكاترة: مجدي توفيق أستاذ البيئة بعلوم عين شمس, ومحمود حسين, وسامح الكفراوي بالهيئة.
استهدفت الدراسة رصد وتتبع التغيرات الحادثة ببحيرة المنزلة من عام2003 حتي عام2012, وتأثيرها علي النظام البيئي للبحيرة, والوصول الي وسائل للحد من التدهور الحادث بها. وأظهرت تركيز الفسفور الكلي في البحيرة عام2003 في الجزء الشرقي بينما ظهر أعلي تركيز له عام2011 في الجزء الشمال الغربي. وكان النيتروجين الكلي في2003 و2011 منتشرا في الجزء الشرقي للبحيرة. بينما ظهر أعلي تركيز للكلوروفيل عام2003 في الجزء الشرقي للبحيرة, وظهر عام2011 في الجزء الشمال الشرقي للبحيرة.
